Die Blaue Moschee hat drei Haupteingänge. Der zentrale Eingang, der sich an der Nordwestseite der Moschee befindet, ist durch ein hohes, vorspringendes Portal gekennzeichnet, das von einer kleinen Kuppel gekrönt wird. Er wird hauptsächlich für feierliche Anlässe und VIP-Eingänge verwendet. Der Eingang an der Südseite ist der Haupteingang, der von Touristen genutzt wird. Sie führt direkt in den Innenhof und das Innere der Moschee. Der Eingang an der Ostseite wird hauptsächlich von Einheimischen und Gläubigen genutzt. Sie bietet Zugang zum Innenhof und dem Inneren der Moschee.